Нэгима?! Весенний спецвыпуск?!

Весенний спецвыпуск застает Нэги Спрингфилда и его учениц из класса 3-А в самый разгар подготовки к грандиозному школьному фестивалю. Казалось бы, обычная суета: украшение залов, репетиции выступлений и бесконечные споры о том, чей стенд лучше. Но идиллию нарушает неожиданное происшествие — в школе начинают пропадать магические артефакты, которые Нэги хранил в секретной комнате. Подозрение падает на всех, и даже Асуна, обычно готовая прикрыть своего учителя, начинает сомневаться в его честности. Пока девочки пытаются вычислить вора, устраивая забавные допросы друг другу и путая следы, Нэги понимает, что кражи — лишь верхушка айсберга. Кто-то явно хочет сорвать фестиваль и заодно выставить молодого волшебника в дурном свете перед всей школой.

Второй сюжетный слой раскрывается через личные истории учениц. Сэцуна пытается признаться в чувствах Коноке, но каждый раз её сбивает с толку внезапное появление Харуны с фотоаппаратом. Тиаки и Макото ссорятся из-за распределения обязанностей на фестивале, и их примирение превращается в череду неловких, но трогательных моментов. А Нэги, разрываясь между поисками вора и желанием поддержать каждую из девочек, случайно находит старую фотографию своего отца, которая намекает на то, что пропажи связаны с давней тайной самой школы. В финале, когда фестиваль вот-вот начнется, выясняется, что артефакты украла маленькая девочка-призрак, которая просто хотела привлечь внимание живых, чтобы её не забыли. Нэги не наказывает её, а вместо этого предлагает всем классом устроить для неё отдельный аттракцион. Спецвыпуск заканчивается массовым танцем под фейерверки, где даже призрак, наконец обретя покой, улыбается и исчезает, оставляя героям чувство светлой грусти и единства.